Paola Picotti: Katalogdaten im Frühjahrssemester 2021

NameFrau Prof. Dr. Paola Picotti
LehrgebietMolekulare Systembiologie
Adresse
Inst. f. Molekulare Systembiologie
ETH Zürich, HPM H 46
Otto-Stern-Weg 3
8093 Zürich
SWITZERLAND
Telefon+41 44 633 25 58
Fax+41 44 633 12 98
E-Mailpicotti@imsb.biol.ethz.ch
DepartementBiologie
BeziehungOrdentliche Professorin

NummerTitelECTSUmfangDozierende
551-0224-00LAdvanced Proteomics Belegung eingeschränkt - Details anzeigen
Für Masterstudierende ab 2. Semester, Doktorierende und Postdoktorierende
4 KP6GP. Picotti, L. Gillet, A. Leitner, P. Pedrioli
KurzbeschreibungZiel dieses Kurses ist es, etablierte und neue Technologien der Protein- und Proteome-Analyse kennenzulernen in Bezug auf ihre Anwendung in Biologie, Biotechnologie und Medizin.
Format: Einführung durch Dozent mit anschliessender Diskussion, unterstützt durch Literaturarbeit und Übungen.
LernzielIm Kurs werden sowohl die bereits etablierten als auch die neuesten derzeit entstehenden Technologien und Methoden in der Protein- und Proteomanlayse diskutiert im Hinblick auf ihre Anwendung in der Biologie, Biotechnologie, Medizin und Systembiologie.
InhaltBlock course teaching current methods for the acquisition and processing of proteomic datasets.
Voraussetzungen / BesonderesNumber of people: Not exceeding 30.
Students from ETHZ, Uni Zurich and University of Basel
Non-ETH students must register at ETH Zurich as special students http://www.rektorat.ethz.ch/students/admission/auditors/index_EN
551-0324-00LSystems Biology Information 6 KP4VP. Picotti, M. Claassen, U. Sauer, B. Snijder, B. Wollscheid
KurzbeschreibungIntroduction to experimental and computational methods of systems biology. By using baker’s yeast as a thread through the series, we focus on global methods for analysis of and interference with biological functions. Illustrative applications to other organisms will highlight medical and biotechnological aspects.
Lernziel- obtain an overview of global analytical methods
- obtain an overview of computational methods in systems biology
- understand the concepts of systems biology
InhaltOverview of global analytical methods (e.g. DNA arrays, proteomics, metabolomics, fluxes etc), global interference methods (siRNA, mutant libraries, synthetic lethality etc.) and imaging methods. Introduction to mass spectrometry and proteomics. Concepts of metabolism in microbes and higher cells. Systems biology of developmental processes. Concepts of mathematical modeling and applications of computational systems biology.
Skriptno script
LiteraturThe course is not taught by a particular book, but some books are suggested for further reading:

- Systems biology in Practice by Klipp, Herwig, Kowald, Wierling und Lehrach. Wiley-VCH 2005
551-0352-00LIntroduction to Mass Spectrometry-Based Proteomics Belegung eingeschränkt - Details anzeigen
Number of participants limited to 12.

The enrolment is done by the D-BIOL study administration.

General safety regulations for all block courses:
-Whenever possible the distance rules have to be respected
-All students have to wear masks throughout the course. Please keep reserve masks ready. Surgical masks (IIR) or medical grade masks (FFP2) without a valve are permitted. Community masks (fabric masks) are not allowed.
-The installation and activation of the Swiss Covid-App is highly encouraged
-Any additional rules for individual courses have to be respected
-Students showing any COVID-19 symptoms are not allowed to enter ETH buildings and have to inform the course responsible
6 KP7PL. Gillet, P. Picotti
KurzbeschreibungProtein-Analyse durch Massenspektrometrie
Die folgende Thematik wird abgedeckt: Grundlagen der biologischen Massenspektrometrie einschliesslich Instrumentation, Datenaufnahme und -bearbeitung; Anwendung zur Identifizierung und Charakterisierung von Proteinen; Probevorbereitung; Proteomic-Strategien einschliesslich quantitative Analysen.
LernzielProbenvorbereitung fuer die MS Analyse (Trypsin Verdau, C18 Aufreinigung)
Prinzipien LC-MS basierter Datenaquisition (QTOF und/oder Ion Trap Instrumenten)
Qualitative Proteom Analyse (Protein Identifizierung mit Hilfe von Mascot und/oder Sequest Software)
Quantitative Proteom Analyse (unmarkierte und Isotopen markierte Strategien)
Analyse und Auswertung von Datensätzen zur Detektion von hoch- bzw. runter-regulierten Proteinen