252-0523-00L  Computational Biology

SemesterHerbstsemester 2014
DozierendeG. H. Gonnet
Periodizitätjährlich wiederkehrende Veranstaltung
LehrspracheEnglisch



Lehrveranstaltungen

NummerTitelUmfangDozierende
252-0523-00 VComputational Biology3 Std.
Mi13:15-14:00CAB G 52 »
Fr13:15-15:00CAB G 52 »
G. H. Gonnet
252-0523-00 UComputational Biology2 Std.
Do14:15-16:00CAB H 56 »
G. H. Gonnet

Katalogdaten

KurzbeschreibungStudy of computational techniques, algorithms and data structures used to solve problems in computational biology. Topics: basic biology, string alignment, phylogeny (distance, character, parsimony), molecular evolution, multiple sequence alignment, probabilistic and statistical models, Markov models, microarrays, dynamic programming, maximum likelihood and specialized DNA and protein analysis.
LernzielFamiliarize the students with the basic concepts of molecular biology and the models and algorithms used to understand, classify and predict behaviour of living organism. This course is at the most basic level, where the main issues, mostly of molecular sequences, are studied.
InhaltThis course lies in the intersection between Computer Science and Molecular Biology. The main purpose is to study computational techniques, algorithms and data structures which are usually applied to solve problems in Molecular Biology and Biochemistry.
The following topics are likely to be covered: Introduction, mathematical models of evolution, protein and DNA sequence alignment and its meaning, phylogenetic tree construction, multiple sequence alignments, secondary structure prediction, molecular dynamics, threading, role of bioinformatics in drug design, etc. From the computer science point of view we concentrate our attention in practical solutions for the above problems. Biological knowledge is an asset but not a prerequisite.

Leistungskontrolle

Information zur Leistungskontrolle (gültig bis die Lerneinheit neu gelesen wird)
Leistungskontrolle als Semesterkurs
ECTS Kreditpunkte6 KP
PrüfendeG. H. Gonnet
FormSessionsprüfung
PrüfungsspracheEnglisch
RepetitionDie Leistungskontrolle wird nur in der Session nach der Lerneinheit angeboten. Die Repetition ist nur nach erneuter Belegung möglich.
Prüfungsmodusschriftlich 180 Minuten
Hilfsmittel schriftlichKeine Hilfsmittel erlaubt, ausser 2 doppelseitige, persönlich von Hand geschriebene A4-Blätter.
Diese Angaben können noch zu Semesterbeginn aktualisiert werden; verbindlich sind die Angaben auf dem Prüfungsplan.

Lernmaterialien

 
HauptlinkInformation
Es werden nur die öffentlichen Lernmaterialien aufgeführt.

Gruppen

Keine Informationen zu Gruppen vorhanden.

Einschränkungen

Keine zusätzlichen Belegungseinschränkungen vorhanden.

Angeboten in

StudiengangBereichTyp
Biologie MasterWahlpflicht Masterkurse I: RechnergestützWInformation
Biomedical Engineering MasterEmpfohlene WahlfächerWInformation
Biomedical Engineering MasterWahlfächer der VertiefungWInformation
CAS in InformatikFokusfächer und WahlfächerWInformation
Chemie- und Bioingenieurwissenschaften MasterWahlfächerWInformation
Computational Biology and Bioinformatics MasterKernfächerWInformation
Gesundheitswissenschaften und Technologie MasterWahlfächer IIWInformation
Informatik MasterKernfächer der Vertiefung Computational ScienceWInformation
Neural Systems and Computation MasterWahlfächerWInformation
Rechnergestützte Wissenschaften BachelorWeitere Wahlfächer aus den Vertiefungsgebieten (RW Master)WInformation
Rechnergestützte Wissenschaften MasterChemieWInformation
Statistik MasterStatistische und mathematische FächerWInformation