701-1708-00L  Infectious Disease Dynamics

SemesterFrühjahrssemester 2019
DozierendeS. Bonhoeffer, R. D. Kouyos, R. R. Regös, T. Stadler
Periodizitätjährlich wiederkehrende Veranstaltung
LehrspracheEnglisch



Lehrveranstaltungen

NummerTitelUmfangDozierende
701-1708-00 VInfectious Disease Dynamics
This lecture will be recorded.
2 Std.
Mo10:15-12:00HG D 16.2 »
S. Bonhoeffer, R. D. Kouyos, R. R. Regös, T. Stadler

Katalogdaten

KurzbeschreibungThis course introduces into current research on the population biology of infectious diseases. The course discusses the most important mathematical tools and their application to relevant diseases of human, natural or managed populations.
LernzielAttendees will learn about:
* the impact of important infectious pathogens and their evolution on human, natural and managed populations
* the population biological impact of interventions such as treatment or vaccination
* the impact of population structure on disease transmission

Attendees will learn how:
* the emergence spread of infectious diseases is described mathematically
* the impact of interventions can be predicted and optimized with mathematical models
* population biological models are parameterized from empirical data
* genetic information can be used to infer the population biology of the infectious disease

The course will focus on how the formal methods ("how") can be used to derive biological insights about the host-pathogen system ("about").
InhaltAfter an introduction into the history of infectious diseases and epidemiology the course will discuss basic epidemiological models and the mathematical methods of their analysis. We will then discuss the population dynamical effects of intervention strategies such as vaccination and treatment. In the second part of the course we will introduce into more advanced topics such as the effect of spatial population structure, explicit contact structure, host heterogeneity, and stochasticity. In the final part of the course we will introduce basic concepts of phylogenetic analysis in the context of infectious diseases.
SkriptSlides and script of the lecture will be available online.
LiteraturThe course is not based on any of the textbooks below, but they are excellent choices as accompanying material:
* Keeling & Rohani, Modeling Infectious Diseases in Humans and Animals, Princeton Univ Press 2008
* Anderson & May, Infectious Diseases in Humans, Oxford Univ Press 1990
* Murray, Mathematical Biology, Springer 2002/3
* Nowak & May, Virus Dynamics, Oxford Univ Press 2000
* Holmes, The Evolution and Emergence of RNA Viruses, Oxford Univ Press 2009
Voraussetzungen / BesonderesBasic knowledge of population dynamics and population genetics as well as linear algebra and analysis will be an advantage.

Leistungskontrolle

Information zur Leistungskontrolle (gültig bis die Lerneinheit neu gelesen wird)
Leistungskontrolle als Semesterkurs
ECTS Kreditpunkte4 KP
PrüfendeR. R. Regös, S. Bonhoeffer, R. D. Kouyos, T. Stadler
FormSemesterendprüfung
PrüfungsspracheEnglisch
RepetitionEs wird ein Repetitionstermin in den ersten zwei Wochen des unmittelbar nachfolgenden Semesters angeboten.
Zusatzinformation zum Prüfungsmodus20-minütige mündliche Prüfung

Lernmaterialien

Keine öffentlichen Lernmaterialien verfügbar.
Es werden nur die öffentlichen Lernmaterialien aufgeführt.

Gruppen

Keine Informationen zu Gruppen vorhanden.

Einschränkungen

Keine zusätzlichen Belegungseinschränkungen vorhanden.

Angeboten in

StudiengangBereichTyp
Biologie MasterWahlpflicht MasterkurseWInformation
Biologie MasterWahlpflicht MasterkurseWInformation
Biologie MasterWahlpflicht MasterkurseWInformation
Biologie MasterWahlpflicht MasterkurseWInformation
Biologie MasterWahlpflicht Masterkurse II: BiologieWInformation
Computational Biology and Bioinformatics MasterVertiefungsfächerWInformation
Computational Biology and Bioinformatics MasterBiologieWInformation
Doktorat Departement UmweltsystemwissenschaftenÖkologie und EvolutionWInformation
Gesundheitswissenschaften und Technologie MasterModul: InfektionskrankheitenWInformation
Gesundheitswissenschaften und Technologie MasterWahlfächer IIWInformation
Lebensmittelwissenschaft MasterModul Infectious DiseasesWInformation
Lebensmittelwissenschaft MasterOptionale FächerWInformation
Physik MasterAllgemeine WahlfächerWInformation
Rechnergestützte Wissenschaften BachelorWeitere Wahlfächer aus den Vertiefungsgebieten (RW Master)WInformation
Rechnergestützte Wissenschaften MasterBiologieWInformation
Umweltnaturwissenschaften MasterA. PrinzipienWInformation
Umweltnaturwissenschaften MasterInfektionskrankheitenWInformation